Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP61Q8NHU2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms