Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT3

TMEM145, Transmembrane protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM145Q8NBT3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM145Q8NBT3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM145Q8NBT3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM145Q8NBT3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms