Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FSIP1Q8NA03 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FSIP1Q8NA03 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FSIP1Q8NA03 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms