Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD1Q8N9Z9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms