Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIML1Q8N9V2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIML1Q8N9V2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms