Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC9Q8N567 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms