Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCL2Q8N4E4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms