Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NINQ8N4C6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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