Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO39Q8N4B4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms