Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT20Q8IY31 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT20Q8IY31 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms