Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLF2Q8IX21 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLF2Q8IX21 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms