Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUDCD3Q8IVD9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms