Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TXNDC2Q86VQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TXNDC2Q86VQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TXNDC2Q86VQ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TXNDC2Q86VQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
TXNDC2Q86VQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TXNDC2Q86VQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.82■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
TXNDC2Q86VQ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TXNDC2Q86VQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms