Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD3Q86UT5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms