Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC39.13■■■■□ 3.86
PBRM1Q86U86 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PBRM1Q86U86 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PBRM1Q86U86 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PBRM1Q86U86 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PBRM1Q86U86 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms