Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF3Q7Z739 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms