Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSX9Q7RTT3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms