Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRADAQ7RTN6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms