Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTOP1Q7RTM1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP1Q7RTM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms