Protein–RNA interactions for Protein: Q7L804

RAB11FIP2, Rab11 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP2Q7L804 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP2Q7L804 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP2Q7L804 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP2Q7L804 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms