Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2AFVQ71UI9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms