Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM47EQ6ZV65 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms