Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A4Q6YBV0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A4Q6YBV0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms