Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM20Q6UY09 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEACAM20Q6UY09 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms