Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG3Q6UXM1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms