Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VSTM1Q6UX27 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms