Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFTA2Q6UW10 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms