Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLC4A10Q6U841 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC4A10Q6U841 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC4A10Q6U841 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A10Q6U841 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A10Q6U841 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A10Q6U841 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A10Q6U841 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A10Q6U841 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A10Q6U841 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A10Q6U841 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms