Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASC1Q6TDU7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CASC1Q6TDU7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms