Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK18

OGFOD3, 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OGFOD3Q6PK18 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OGFOD3Q6PK18 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OGFOD3Q6PK18 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OGFOD3Q6PK18 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms