Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC174Q6PII3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC174Q6PII3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms