Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO42Q6P3S6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms