Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ZDHHC6-203ENST00000471035 349 ntTSL 20.13□□□□□ -2.399e-7■■■■■ 55.2
PRPF8Q6P2Q9 NDUFAF7-210ENST00000469831 845 ntTSL 211.61□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 55.2
PRPF8Q6P2Q9 NDUFAF7-203ENST00000416653 473 ntTSL 310.02□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 55.2
PRPF8Q6P2Q9 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 55.2
PRPF8Q6P2Q9 AP000873.2-208ENST00000500634 876 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.43e-7■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.453e-7■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -23e-7■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.33e-7■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 AGFG1-208ENST00000486932 566 ntTSL 42.57□□□□□ -28e-7■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPC-220ENST00000555585 682 ntTSL 27.71□□□□□ -1.186e-8■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.057e-22■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 PARK7-210ENST00000497113 670 ntTSL 312.23□□□□□ -0.457e-22■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 PARK7-202ENST00000377488 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.847e-22■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 PARK7-207ENST00000469225 711 ntTSL 37.95□□□□□ -1.147e-22■■■■■ 55.1
PRPF8Q6P2Q9 RFC4-203ENST00000411792 560 ntTSL 515.32■□□□□ 0.048e-8■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 TSTA3-213ENST00000531006 860 ntTSL 217.53■□□□□ 0.48e-10■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 TSTA3-211ENST00000529899 568 ntTSL 215.97■□□□□ 0.158e-10■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 TSTA3-204ENST00000526290 488 ntTSL 314.37□□□□□ -0.118e-10■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-28■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 TCERG1-214ENST00000514719 573 ntTSL 31.93□□□□□ -2.12e-28■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 TCERG1-203ENST00000503741 578 ntTSL 31.92□□□□□ -2.12e-28■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 ASAP1-204ENST00000519169 708 ntTSL 20.38□□□□□ -2.355e-7■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 ASAP1-216ENST00000524367 962 ntTSL 50.24□□□□□ -2.375e-7■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.057e-11■■■■■ 55
PRPF8Q6P2Q9 TTL-203ENST00000476615 725 ntTSL 38.03□□□□□ -1.123e-13■■■■■ 54.9
PRPF8Q6P2Q9 SART3-210ENST00000548119 558 ntTSL 32.91□□□□□ -1.941e-9■■■■■ 54.9
PRPF8Q6P2Q9 SLC11A2-220ENST00000550061 652 ntTSL 38.13□□□□□ -1.116e-9■■■■■ 54.8
PRPF8Q6P2Q9 PLSCR1-211ENST00000483300 514 ntTSL 52.13□□□□□ -2.071e-7■■■■■ 54.8
PRPF8Q6P2Q9 PLSCR1-207ENST00000470496 340 ntTSL 50.38□□□□□ -2.351e-7■■■■■ 54.8
PRPF8Q6P2Q9 STAT2-211ENST00000557252 717 ntTSL 28.2□□□□□ -1.16e-12■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 LRRC37B-218ENST00000583342 725 ntTSL 217.03■□□□□ 0.327e-11■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 LRRC37B-208ENST00000579206 733 ntTSL 39.38□□□□□ -0.917e-11■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 LRRC37B-213ENST00000581370 393 ntTSL 32.65□□□□□ -1.997e-11■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 NDUFAF7-207ENST00000439218 934 ntTSL 34.85□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 RBBP4-201ENST00000373485 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 RBBP4-214ENST00000492348 1547 ntTSL 25.66□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 RBBP4-210ENST00000475321 619 ntTSL 51.88□□□□□ -2.112e-7■■■■■ 54.7
PRPF8Q6P2Q9 NDE1-211ENST00000576502 1131 ntTSL 211.85□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 NDE1-206ENST00000572967 484 ntTSL 310.05□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 NDE1-208ENST00000573694 411 ntTSL 38.02□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-212ENST00000480679 505 ntTSL 517.95■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-223ENST00000493222 864 ntTSL 317.95■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.459e-7■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-227ENST00000497510 722 ntTSL 417.14■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 SNRNP25-201ENST00000293861 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-213ENST00000482668 645 ntTSL 315.71■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-214ENST00000483108 598 ntTSL 413.64□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-217ENST00000484142 553 ntTSL 413.64□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-206ENST00000467400 717 ntTSL 513.56□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 SNRNP25-203ENST00000397876 831 ntTSL 312.36□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-216ENST00000484056 606 ntTSL 511.78□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 SNRNP25-207ENST00000493672 329 ntTSL 510.33□□□□□ -0.762e-14■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 SNRNP25-204ENST00000417493 408 ntTSL 59.44□□□□□ -0.99e-7■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-220ENST00000487640 566 ntTSL 46.6□□□□□ -1.354e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.714e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.194e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-204ENST00000465515 668 ntTSL 20.14□□□□□ -2.394e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.444e-6■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 DNMT1-208ENST00000586667 714 ntTSL 210.48□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 54.6
PRPF8Q6P2Q9 GPATCH8-205ENST00000587228 4713 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.058e-30■■■■■ 54.5
PRPF8Q6P2Q9 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.098e-30■■■■■ 54.5
PRPF8Q6P2Q9 GPATCH8-202ENST00000585614 686 ntTSL 37.87□□□□□ -1.158e-30■■■■■ 54.5
PRPF8Q6P2Q9 GPATCH8-210ENST00000592746 457 ntTSL 54.09□□□□□ -1.758e-30■■■■■ 54.5
PRPF8Q6P2Q9 GPATCH8-203ENST00000586037 345 ntTSL 53.62□□□□□ -1.838e-30■■■■■ 54.5
PRPF8Q6P2Q9 GPATCH8-207ENST00000590041 829 ntTSL 51.74□□□□□ -2.138e-30■■■■■ 54.5
PRPF8Q6P2Q9 IST1-210ENST00000537571 603 ntTSL 24.44□□□□□ -1.78e-12■■■■■ 54.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF638-227ENST00000601581 574 ntTSL 50.43□□□□□ -2.341e-9■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 21.78□□□□□ -2.122e-21■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 ENPP3-205ENST00000427707 1536 ntTSL 1 (best)6.74□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 FANCA-219ENST00000566133 761 ntTSL 39.62□□□□□ -0.871e-22■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 TMPO-209ENST00000549938 696 ntTSL 418.15■□□□□ 0.51e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.131e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 LINC00910-205ENST00000592094 1042 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.011e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM14B-216ENST00000486421 505 ntTSL 512.68□□□□□ -0.381e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.541e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.571e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 PPIG-205ENST00000418888 525 ntTSL 411.46□□□□□ -0.574e-11■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.591e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM14B-213ENST00000478732 344 ntTSL 510.81□□□□□ -0.681e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 RGL1-201ENST00000304685 5100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 LINC00910-204ENST00000588654 541 ntTSL 410.27□□□□□ -0.771e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 LINC00910-202ENST00000586231 2890 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.951e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 ITPK1-204ENST00000553655 390 ntTSL 57.96□□□□□ -1.131e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 DROSHA-215ENST00000512076 1124 ntTSL 1 (best)7.06□□□□□ -1.282e-9■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 DDX59-203ENST00000429498 725 ntTSL 37□□□□□ -1.291e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 KRR1-204ENST00000550898 694 ntTSL 25.81□□□□□ -1.481e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM14B-207ENST00000467229 483 ntTSL 35.74□□□□□ -1.491e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 TSEN2-208ENST00000455118 784 ntTSL 35.39□□□□□ -1.557e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 VEZF1-201ENST00000258963 3948 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 54.4
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 446.4 ms