Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1X6

C8orf82, UPF0598 protein C8orf82, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf82Q6P1X6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf82Q6P1X6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms