Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN1Q6NZI2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms