Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHLDB3Q6NSJ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PHLDB3Q6NSJ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHLDB3Q6NSJ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1000.7 ms