Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPATA1Q5VX52 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms