Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRCH2Q5VUJ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms