Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACHD1Q5VU97 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms