Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms