Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC38Q5VT99 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms