Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOGA3Q5TF21 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SOGA3Q5TF21 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms