Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SAMD4BQ5PRF9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms