Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPDYCQ5MJ68 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYCQ5MJ68 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYCQ5MJ68 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms