Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN4Q5MJ08 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN4Q5MJ08 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms