Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms