Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB41Q5JT25 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB41Q5JT25 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms