Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD3Q5JSP0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms