Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf116Q5BN46 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms