Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB6CQ53S08 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms